El dúo de matones, Rough y Tumble, regresan buscando venganza contra Sonic y sus amigos. Y no son los únicos... algunos de los peores enemigos de Sonic regresaron y, con la ayuda de algunos nuevos aliados malvados, crearon una amenaza que con seguridad se apoderará del mundo. Ni siquiera Sonic puede dejar atrás durante mucho tiempo a un virus.