Ryuuko Matoi es una chica que va a todos lados con una parti cular media tijera roja, buscando al portador de la otra med ia tijera, quien mat a su padre. El instituto Honouji es una escuela secundaria reinada por el miedo, impartido por el c onsejo estudiantil. Su presidente, Satsuki Kiryuuin, usa pod erosos uniformes para acabar con cualquiera que se cruce en su camino. Tras que Ryuuko sufriese una aplastante derrota a manos de Satsuki, considera que llega la hora de empezar a usar un uniforme escolar posedo llamado Senketsu, que le oto rga habilidades especiales. Es hora de que Ryuuko termine co n la tirana de Satsuki y el consejo estudiantil para no slo liberar al instituto Honouji de su mano de hierro sino adems descubrir la verdad detrs de la muerte de su padre.